（三）寸灘作業區工程
作為長江上游最大的集裝箱樞紐港，寸灘港對于重慶打造長江上游航運中心，發展大物流，推進“一圈兩翼”建設，促進城鄉統籌，具有舉足輕重的意義。寸灘作業區工程建成后，將極大的推進重慶市的“一城一港”戰略，為促進港口物流發展一體化，發展大港口、大物流發揮積極的作用。
近年來，隨著重慶市經濟的快速發展，三峽成庫后航運條件的改善，重慶水運發展迅猛。2006年，水路貨運周轉量已占全市總量的65%，大大超過鐵路以及其他運輸方式，全市90%以上的進出口外貿物資通過水路運輸完成。作為建設以“九港”為主導的長江上游最大的港口物流樞紐工程中重要的一環，重慶寸灘作業區工程分三期實施，一期工程總投資86466萬元，已通過竣工驗收。二期工程建設3000噸級集裝箱泊位3個，設計年吞吐能力42標箱，汽車滾裝泊位1個，設計年吞吐能力15萬輛，占地約850畝。總投資計劃110108萬元，預計將于今年底建成投產。三期工程建設3000噸級集裝箱泊位4個，設計年通過能力50萬標箱，并建設與整個碼頭相配套的港口物流園區，占地約1100畝。總投資計劃295000萬元，主體工程已全面開工。
依托寸灘港區為核心之一的內陸首個保稅港區—重慶寸灘保稅港區已于2009年6月2日正式開工，它的建成將有力推動重慶外向型經濟的發展，成為中西部內陸城市加快開放的推進器。
（四）船舶標準化、大型化工程
長江及其支流是重慶最主要的運輸通道。近年來，長江水運迅速發展，尤其是三峽成庫后，重慶的長江上游航運中心地位日益凸顯。然而，在水運業火爆的同時，重慶船舶發展卻在一定程度上表現得雜亂無章，不規范、不標準的船型紛紛出現，并造成三峽船閘擁堵，影響了航運效率。為改變低水平運力過剩、高水平運力不足的局面，自2003年三峽成庫以來，長江上游就開始實施船舶標準化工作，加快推進船型標準化、專業化、大型化，發展江海直達運輸，全面提高船舶運輸效率。
經過多年的積極建設，一批適合新型運輸方式的集裝箱、化危品、干散貨、滾裝汽車和旅游客運等專業化運輸船舶得到快速發展，標準化船舶數量達到35%，運力達到60%。2008年，全市貨運船舶平均噸位達到1300噸以上，居全國內河之首，是1999年的20.3倍。船舶單位能耗明顯降低，1千瓦功率載貨量由1999年的1.5噸提高到6噸，平均單位能耗由1999年的7.6千克/千噸·千米下降到了2008年的3.1千克/千噸·千米，降幅達59%，按2002年燃油單耗水平比較，2008年共節約燃油近40萬噸，節油效益達21億元。建造標準化、大型化船舶，單位載重噸消耗鋼材明顯下降，500噸級貨運船舶單位載重噸鋼材消耗量為315公斤，而5000噸級僅為180公斤。普通客運船舶已逐步被一批具有國際品質的內河豪華游輪替代。
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