資源價格改革與管理通脹的沖突
經濟的可持續發展要求經濟要素反映其稀缺性，反映其市場價值。能源價格改革是科學發展觀的重要經濟含義。在今年的政府工作報告中提出，之所以提出CPI漲幅3%左右，為資源環境稅費和資源性產品價格改革留有一定空間。所以，能源資源價格改革所面臨的宏觀經濟背景，不是簡單了，而是變得更加復雜了。
短期決策與長期規劃的沖突
轉變經濟發展方式作為一項長期的政府主導的戰略性工程，這就必然導致一些短期的宏觀經濟政策與長期的戰略規劃之間發生沖突。這實際上也是很多“兩難”問題出現的重要背景。
節能減排與重化工業發展的沖突
考慮到重化工業在中國經濟中占有重要地位的現實，一方面，中國經濟復蘇的重點在于重化工業領域的投資和發展，這與長期我國產業調整的方向并不一致。另一方面，在重化工業和節能環保之間的沖突或將長期存在。在實現節能減排的兩種路徑(技術減排和結構減排)中，都需要一定的時間，這與當下現實的壓力存在沖突。
土地商業化與保護耕地的沖突
地方政府希望在土地價格快速上漲中大量投入土地，使地方土地出讓金和相關房地產收入大幅度增長；而中央政府卻希望城市化進程不能過度減少農用耕地，平衡房地產發展與農業之間的關系，由此產生在調控土地市場上中央與地方之間的沖突。
寬松貨幣政策與防范資產泡沫沖突
出于對實體經濟的刺激需求，必須繼續實行適度寬松的貨幣政策，而流動性大量涌向資本市場和房市，導致資產價格暴漲和房價泡沫風險加大。（《中國經濟周刊》記者 王紅茹 葉建國 劉永剛）
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